tutorial: ExPASy base de datos de proteínas (I)

08 noviembre, 2008 ·

De ésta forma doy comienzo a un pequeño tutorial sobre ExPASy y como utilizarlo, de manera de sacarle el mayor provecho a las bases de datos de proteínas para tu estudio, investigación...
Expert Protein Analysis System (ExPASy) es un servidor de proteomica fundada y mantenida por la SIB (Swiss Institute of Bioinformatics) desde 1993. Su base de datos incluyen miles de proteínas caracterizadas y dedicadas al análisis de la secuencia de proteínas así como de su estructura 2D y 3D.´Es una herramienta para todos aquellos que nos interesa el área de la bioinformática e investigadores del área de la bioquímica, genética, biología celular y molecular. ExPASy es una base de datos, actualizada, de prácticamente todas las proteínas caracterizadas de todos los reinos.

ExPASy cuenta con secuencias de aminoácidos con sus polimorfismos, la estructura proteica 3D y 2D en pruebas de electroforesis , links a artículos de revistas biomédicas con información sobre la búsqueda, links a bases de datos genéticas, biológicas.La búsqueda de la proteína que necesites debe ser especifica, ya que la base de datos es muy amplia...no solo arroja los resultados en base al nombre de la proteína que introduzcamos en la barra de búsqueda, sino que expresa cada una de las que tengan alguna relación con la misma. Por ejemplo si introducimos el criterio "insulin" (insulina) no sólo aparecerán todas las moléculas de insulina caracterizadas en el reino animal sino que también aparecerán los receptores de insulina, los IGF (factores de crecimiento insulinoide), sustrato del receptor de insulina (IRS-1) entre otros.

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